周末一般是不可以办健康证的。事业单位、行政机关的工作时间一般是周一到周五，每日工作8小时、每周工作40小时。而星期六和星期日为周休息日，一般不上班。因此当事人不能在周末申请办理健康证，而是应当在每周的工作日中来申请办理。
法律依据：《国务院关于职工工作时间的规定》第四条
在特殊条件下从事劳动和有特殊情况，需要适当缩短工作时间的，按照国家有关规定执行。
第六条
任何单位和个人不得擅自延长职工工作时间。因特殊情况和紧急任务确需延长工作时间的，按照国家有关规定执行。
第七条
国家机关、事业单位实行统一的工作时间，自本规定施行之日起，第一周星期六和星期日为休息日，第二周星期日为休息日，依此循环。
如何办理健康证
1、身份证以及个人免冠一寸彩照两张，到交费处交纳体检费，领取体检表黏贴照片，填好姓名、性别等基本情况；
2、检验室采血，大便化验；
3、内外科常规体检；
4、X光胸透；
5、完成全面体检项目，从而领取健康证。
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